La inceputurile secolului XX, Juan Baqué Fargas deținea un depozit în centrul orasului Bilbao. In acea perioada i-a fost acordat dreptul de a vinde și distribui cafea și produse din cafea. Mai târziu, doi dintre fii lui Juan Baqué, Emilio și Francisco vor prelua și administra ceea ce în acele timpuri se cunoștea precum Compaña Viuda e Hijos de Juan Baqué (Compania Văduvei și fiilor lui Juan Baqué). La jumătatea secolului XX, compania și-a mutat afacerile în Durango, un sat înfloritor din regiunea Bizcaya în Țara Bascilor, regiune care începuse să prospere foarte mult din punct de vedere economic. In Pinondo, destul de aproape de Hotelul Durango au început o afacere cu pile, șmirghel și rașpăle, împreună cu prăjitul și ambalatul de cicoare în Barrencalle. Din 1968 Cafés Baqué a început să devină o marcă recunoscută în lumea cafelei.
În 1976, firma a facut cea mai importanta mișcare, odată cu mutarea ei în locația pe care o deține și care e sediul central al firmei. De aici dispune de conexiuni cu rețelele de transport mai ales după ce calea ferata Bilbao – Behobia s-a construit chiar în apropierea noii locații. Acela a fost anul în care Cafés Baqué a crescut cel mai mult, încorporând noi mașini de prăjit și ambalat precum și construirea de noi silozuri pentru cafea verde, cu capacitate mult mai mare, ceea ce a plasat Baque între primele 10 firme distribuitoare de cafea din Spania.
